仁慈堂原名「聖母慈善會」，是葡萄牙王后在1491年創辦的慈善組織。後來，這機構的慈善工作逐漸由葡萄牙本土推廣到有葡萄牙人居住的所有地方。

澳門仁慈堂於1569年由擔任中國及日本首任天主教主教的賈尼路創建，是澳門的第一所慈善組織。澳門仁慈堂的第一項工作，就是籌建聖肋菲醫院。這不僅是澳門第一所醫院，也是在中國境內的第一間西醫院。

現存的仁慈堂大樓建於1905年，建築物甚有天主教的文化特色。它潔白的外貌，給人一種莊嚴的感覺。堂內可以見到許多天主教教會祭器及用品，還存有創辦人賈尼路主教的頭骨，供後人紀念。

澳門著名的「婆仔屋」，也是仁慈堂的物業。這早年原是一所女老人院，「婆仔屋」之名因此而來。1999年，院內的婆婆已遷往新的老人院，現今被澳門文化局列為受保護的文物建築。